Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec2Q9WV35 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms