Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms