Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11cQ9QZW0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms