Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Col4a4Q9QZR9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Col4a4Q9QZR9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Col4a4Q9QZR9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a4Q9QZR9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Col4a4Q9QZR9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Col4a4Q9QZR9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Col4a4Q9QZR9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Col4a4Q9QZR9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a4Q9QZR9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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