Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim44Q9QXA7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms