Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thsd1Q9JM61 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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