Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Rabgef1Q9JM13 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rabgef1Q9JM13 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rabgef1Q9JM13 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rabgef1Q9JM13 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms