Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5oQ9DB20 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5oQ9DB20 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms