Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DA42 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DA42 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DA42 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9DA42 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9DA42 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9DA42 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9DA42 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9DA42 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9DA42 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9DA42 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9DA42 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DA42 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms