Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmco5aQ9D9D5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms