Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms