Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Derl3Q9D8K3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms