Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms