Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms