Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2e1Q9D0D5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms