Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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