Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms