Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc5Q9CQA1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms