Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms