Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chmp3Q9CQ10 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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