Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms