Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcg3Q99P81 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcg3Q99P81 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms