Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdca3Q99M54 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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