Protein–RNA interactions for Protein: Q99LP8

Yipf2, Protein YIPF2, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf2Q99LP8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yipf2Q99LP8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms