Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxp3Q99JB6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxp3Q99JB6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxp3Q99JB6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxp3Q99JB6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxp3Q99JB6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxp3Q99JB6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxp3Q99JB6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxp3Q99JB6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms