Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Odf3Q920N1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Odf3Q920N1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Odf3Q920N1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Odf3Q920N1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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