Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Abcf3Q8K268 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Abcf3Q8K268 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Abcf3Q8K268 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf3Q8K268 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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