Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R2

Gm3411, Predicted gene 3411, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3411Q8C7R2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3411Q8C7R2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3411Q8C7R2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms