Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trerf1Q8BXJ2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trerf1Q8BXJ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms