Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot10Q8BH15 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms