Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms