Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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