Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms