Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pcp4l1Q6W8Q3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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