Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc154Q6RUT8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms