Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms