Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms