Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l2Q6KAU8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg16l2Q6KAU8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms