Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms