Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp4Q68FH0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms