Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltcQ68FD5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltcQ68FD5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms