Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt12Q64291 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms