Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttf1Q62187 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttf1Q62187 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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