Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1eQ61290 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms