Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Satb1Q60611 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms