Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Xrcc1Q60596 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Xrcc1Q60596 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Xrcc1Q60596 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Xrcc1Q60596 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Xrcc1Q60596 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc1Q60596 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc1Q60596 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc1Q60596 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc1Q60596 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc1Q60596 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc1Q60596 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms