Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d1Q5SSN7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms