Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt35Q497I4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt35Q497I4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms