Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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