Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr1d1Q3UV55 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms